Na Santorini znaleźć można wiele kościołów bizantyjskich. Zazwyczaj mają one bielone ściany i okrągłe, niebieskie kopuły z białym krzyżem na szczycie. Dominują one w krajobrazie miasteczek Oia i Fira leżących na zboczach kaldery. Mniejsze kaplice to małe budynki o prostej konstrukcji z łukowym sklepieniem, przypominające w swym wnętrzu lokalne, tradycyjne domy jaskinie. Wiele dzwonnic posiada zestawy dwóch, trzech, a nawet więcej dzwonów, tak ważnych w obrządku greckim.