San Pablo Villa de Mitla leży w dolinie, a nie na szczycie góry, ani na stoku jak wiele innych ruins, które znamy w Mezoameryce. W Mitla nie ma piramid, znaleźć można tu tylko prehiszpańskie zabudowania. Pałac zawiera charakterystyczne dla Zapoteków delikatne zdobienia w formie geometrycznych wzorów i malowideł. Był on wciąż zamieszkały, gdy pojawili się tu Hiszpanie, lecz wkrótce po ich przybyciu został zniszczony. Fundamenty i materiały z pogańskiej świątyni użyte zostały przez Hiszpanów do budowy kościoła San Pedro.