Nojpetén, stolica królestwa Majów Peten Itza, była gęsto zabudowana świątyniami, pałacami i domami krytymi strzechą. Według hiszpańskich przekazów z 1698 r. w mieście znajdującym się na wyspie gwatemalskiego jeziora Petén Itzá mogło znajdować się ponad 20 świątyń. Budynki wydawały się być bardzo podobne do głównych piramid w Chichen Itza i Mayapan. Byo tak prawdopodobnie dlatego, że po upadku tamtych miast na Jukatanie, mieszkańcy Itza przenieśli się tutaj i zbudowali miasto Nojpetén jako swoją stolicę. Miasto zostało zdobyte w 1697 jako ostatnie, które wpadło w ręce hiszpańskich konkwistadorów. Ta data wyznacza koniec cywilizacji Majów.
Gdy miasto Majów upadło, Hiszpanie całkowicie je zniszczyli. Wymagało to prawdopodobnie sporego wysiłku, a kamień został użyty do budowy nowych obiektów. Na ruinach Hiszpanie wznieśli nowe kolonialne miasto, z kościołem w najwyższym, centralnym punkcie wyspy. Nowe kolonialne miasto znane jest dziś jako Flores. Na placu obok kościoła zauważyliśmy oryginalne fragmenty kilku starożytnych steli Majów. To jedyne pozostałości po starym Nojpetén.
